中华倒刺鲃微卫星标记筛选及特征分析
Isolation and Characterization of Microsatellite Loci in Spinibarbus sinensis(Bleeker)
投稿时间:2010-04-15  修订日期:2010-11-29
DOI:
中文关键词:中华倒刺鲃  基因组富集文库  微卫星  多态性  
英文关键词:Spinibarbus sinensis  enriched genomic library  microsatellite  polymorphism
基金项目:乌江彭水水电站水生生物监测(PS/HB011-2006);乌江银盘水电站水生生物监测(WL/HB005-2008)
作者单位E-mail
熊美华* 水利部中国科学院水工程生态研究所湖北武汉 430079 dreamer@mail.ihe.ac.cn 
史 方 水利部中国科学院水工程生态研究所湖北武汉 430079  
徐 念 水利部中国科学院水工程生态研究所湖北武汉 430079  
阙延福 水利部中国科学院水工程生态研究所湖北武汉 430079  
杨 钟 水利部中国科学院水工程生态研究所湖北武汉 430079  
胡菊香 水利部中国科学院水工程生态研究所湖北武汉 430079  
朱 滨 水利部中国科学院水工程生态研究所湖北武汉 430079  
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中文摘要:
      以乌江流域中华倒刺鲃(Spinibarbus sinensis)为材料,构建了中华倒刺鲃微卫星富集文库。以乌江彭水电站所采集的32个个体的基因组DNA为模板,进行PCR扩增,结果筛选出8个多态性微卫星位点,其等位基因数4~10,多态信息含量0.6072~0.8515;观测杂合度0.5625~1.0000,期望杂合度0.6791~0.8795,Hardy中华倒刺鲃微卫星标记筛选及特征分析Weinberg平衡偏离指数-0.2009~0.3805;卡方检验结果表明,3个位点不同程度地偏离了Hardy中华倒刺鲃微卫星标记筛选及特征分析Weinberg平衡(P<0.05);各位点两两之间不存在显著的连锁不平衡现象。
英文摘要:
      The microsatellite markers of Spinibarbus sinensis were isolated in this study. A library of partial small size fractionated genomic DNA was constructed with the S. sinensis in Wujiang river. Eight microsatellite loci were isolated and characterized. These loci showed high levels of genetic polymorphism testing on 32 individuals sampled from Wujiang river. The number of alleles per locus ranged from 4 to 10. PIC changed from 0.6072 to 0.8515. The observed(Ho) and expected(He) heterozygosities were 0.5625 to 1.0000 and 0.6791 to 0.8795,respective1y. Hardy-Weinberg departure value (D) ranged from-0. 2009 to 0. 3805. The Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) analysis showed that 3 loci deviated from genetic equilibrium significantly(P<0.05). No linkage disequilibrium was found.
熊美华,史 方,徐 念,阙延福,杨 钟,胡菊香,朱 滨.2011.中华倒刺鲃微卫星标记筛选及特征分析[J].水生态学杂志,32(1):40-44.
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