黑斑原鮡AFLP分析体系的建立
The Construction of AFLP Analysis System in Glyptosternum maculatum
投稿时间:2010-07-28  修订日期:2010-12-24
DOI:
中文关键词:AFLP  黑斑原鮡  反应体系
英文关键词:AFLP  Glyptosternum maculatum, reaction system
基金项目:国家海洋公益性行业科研专项(201005013);海洋渔业科学与技术浙江省重中之重学科开放课题(20100105);浙江海洋学院人才引进启动项目(21135011509)。
作者单位E-mail
郭宝英 .浙江海洋学院海洋科学学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室浙江舟山 316004
2.华中农业大学水产学院湖北武汉 430072 
guobaobao1981@yahoo.com.cn 
谢从新* 华中农业大学水产学院湖北武汉 430072 xiecongxin@mail.hzau.edu.cn 
祁鹏志 浙江省大海洋科技有限公司浙江舟山 316004  
吴常文 .浙江海洋学院海洋科学学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室浙江舟山 316004  
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中文摘要:
       建立黑斑原鮡(Glyptosternum maculatum)AFLP反应体系,对DNA提取、双酶切、连接、预扩增、选择性扩增和银染效果进行了探索。结果表明,40μLTaqI酶切体系中65℃先酶切2h,EcoRI酶切和连接同时进行,EcoRI酶和T4DNA连接酶的用量均以2U为宜,温度与时间分别为37℃和3h,连接产物稀释10倍作为预扩增的模板。利用这种优化的反应体系,5对选择性扩增引物组合表现出较高的稳定性、清晰度和多态性,它们分别是:E-AAC/T-AAT、E-AAC/T-AAG、E-AAG/T-ACA、E-AAG/T-AAT和E-AAT/T-AGA。5对引物组合对96个样本扩增,共得到332条清晰可辨、可重复的条带,平均每对引物组合扩增出66.4条带,其中51条带是多态的。将AFLP技术用于黑斑原鮡的研究,通过优化体系的建立,为其种质资源的研究奠定基础。
英文摘要:
      In this study,amplified fragment length polymorphism(AFLP) reaction system was established for Glyptosternum maculatum,mainly optimized DNA extraction,two enzyme digestion,ligation,pre-amplification,selective amplification and the effect of silver-staining. As a result,template DNA(100-400 ng) was double digested in 40μL of reaction mixture using 5 U Taq I and 10 U EcoR I enzymes at 65℃ for 2 h and then 37℃ for 3 h. Using this suitable AFLP reaction system,five primer combination which were E-AAC/T-AAT, E-AAC/T-AAG, E-AAG/T-ACA,E-AAG/T-AAT and E-AAT/T-AGA can amplify clear polymorphic and stable bands. Five primercombinations detected 332 products,51 of them(15.4%)were polymorphic in at least one population. AFLP technique was applied in Glyptosternum maculatum research; utilization of this improved technique may lay the groundwork for further research of germplasm resource for Glyptosternum maculatum.
郭宝英,谢从新,祁鹏志,吴常文.2011.黑斑原鮡AFLP分析体系的建立[J].水生态学杂志,32(3):127-131.
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